O HHV-6 é um agente comum, causador do exantema subito na infancia. Em algumas criancas o quadro de infecção pode ser mais severo com meningite e hepatite. Depois da infecção primária o vírus permanece quiescente no indivíduo.
Em indivíduos imunossuprimidos, principalmente em transplantados de medula, o vírus pode voltar a replicar levando a um quadro grave de pneumonite, meningite ou encenfalite.