A caracterização molecular do genoma HBV permite a identificação dos principais genótipos circulantes em determinadas regiões além das mutações associadas à resistência a medicamentos antivirais. É sabido que alguns genótipos estão associadas às formas mais graves da infecção pelo HBV e outros por formas mais brandas. Estes dados são essenciais na interpretação do quadro clínico do paciente e consequente seguimento do tratamento.